ISSR是最近发展的一种基于PCR技术的分子标记，已在植物种质鉴别和遗传多样性分析等方面得到广泛应用。本文对其在茶树品种分子鉴别和亲缘关系的适用性进行分析，利用筛选出的8个ISSR引物对六个茶树品种的基因组DNA进行扩增，共扩增出99条带，多态性平均为79．6％。由两个ISSR引物TR122和TR130扩增的指纹图谱可清楚区分六个不同品种，利用特殊ISSR标记的存在或缺失以及不同标记组合也可以鉴别不同品种。根据Nei-Li系数将六个品种聚为两类，茂绿、翠峰、青峰、迎霜和劲峰五个品种聚为一类，龙井43单独聚成一类，聚类分析证实了它们的亲缘关系。结果显示，ISSR作为一种信息量高、重演性好的分子标记，应用于茶树品种鉴别和亲缘关系分析是非常有效的。完成机构：[1]中国农业科学院茶叶研究所，浙江杭州310008 [2]杭州市农业科学院茶叶研究所，浙江杭州310024